1979年建馆。初名敦煌县博物馆。前身是敦煌县文化馆。
    
    其有关敦煌遗书的藏品，来源有二：一是1953年前后敦煌县人民政时陆续移交给县文化馆；二是历年从民间征集。有卷轴式写本315卷，其中藏文237卷，汉文78卷；又有藏文贝叶本写经8482页。藏品包括蔺国栋旧藏《天宝地志》、《星图》、《占云气书》和任子宜旧藏《六祖坛经》、《坛语》、《定是非论》等具有重要学术价值的写本。甘肃人民出版社出版的《甘肃藏敦煌文献》第6卷刊布其馆藏。